由于叶绿素本身的结构和组成特性，使叶绿素可见光的蓝光(470 nm)和红光波段(670 nm)有较强的吸收，叶绿素仪正是利用这个特性而研发。在红光波段受藻类叶绿素弹性散射的影响，光谱反射率逐渐增加，在700 nm左右达到峰值，随波长的增加受水分子强吸收的影响，反射率逐渐下降。在红光波段，随叶绿素浓度的增加，反射峰强度逐渐增加。

　　叶绿素在红波段的反射峰强度同浓度有较好的线件相关性，其决定系数达0．982，利用叶绿素浓度同反射峰强度的相关关系，进行叶绿素浓度的反演，有较好的反演效果，其RMSE为1.944 ug·L-1。但是当叶绿素浓度达到10ug·L-1时，这种线性相关关系逐渐减弱，当叶绿素浓度达到l 000ug·L-1时，红波段反射峰强度和叶绿素浓度则呈现较好的对数关系，决定系数达0.965。

　　叶绿素仪能储存几千个测量结果，包含测量数值及相关联的植物名称、时间及传感器温度（读取关联数据需要atLEAFSoft PRO软件）；植物名称长度多32个字符（显示28个字符）。