光合仪既可在叶室（反应器）中进行测定，也可以直接在室外使用，所以它是活体、离体皆可测量。匹配各种类型的叶室（反应器），就可以适用于各种植物叶片、种子、昆虫等不同测量对象。叶室对于光合仪测定分析有重要的辅助作用。在很多测定试验中技术人员会测试光合仪在空叶室条件下的数据是何呢？

　　空叶室即叶室中不加入任何叶片，该测定主要是测试光合仪在空叶室条件下的净光合速率A。空叶室的净光合速率值A可以反映整个光合作用测量系统性能的优劣。通常，我们使用差分式的测量方法计算叶片的净光合速率A。如下式中，通过测定参比腔室和样品腔室CO2浓度，利用其差值来计算A。在测量时，既要保证系统进气的稳定，由CO2r来反映；又要保证夹叶片腔室不漏气，由CO2s来反映；由于这两个值由两套分析器分别测量，还要保证两者的一致性。例如在空叶室条件下，两者差值的理论值为0。

　　差分式：

　　A=Flow[CO2r-CO2s（1000-H2Or/1000-H2Os）]/100*Leaf Area。

　　利用这一点，就能毫不费力的测量羽量级样品的光合气体交换，如阴生植物叶片、微小叶片，或是暗呼吸速率。